新生兒體溫低的原因有很大程度上是受寒冷刺激。新生兒體表面積相對較大散熱大於產熱，環境溫度低於中性溫度以下時，未有效保暖，不能維持體溫，常使皮溫降到35℃以下形成低體溫。
新生兒肝臟儲存的糖原量很少，如果攝食不足在生後18～24h內即可耗盡，會導致新生兒體內保證體溫的能量減少，內生熱不足，使得新生兒體溫降低。
新生兒體溫低的原因還包括缺氧和神經系統功能障礙。新生兒產熱的主要部位在棕色脂肪，棕色脂肪中脂肪酸的代謝分解需要有完善的神經系統功能和充分的氧供應新生兒在缺氧和神經系統功能障礙時棕色脂肪不能利用化學產熱過程常不能進行，易出現體溫不升。
新生兒患敗血症肺炎等感染性疾病時由於進食減少熱量攝入不足;因休克、酸中毒和微循環障礙等影響棕色脂肪分解使體內產熱減少，此時如環境溫度偏低，保暖不夠嬰兒很易引起低體溫。
體溫在33～35℃時，機體可通過增加產熱與失熱達到平衡。體溫在33℃以下時，機體不能產生足夠的熱來補充散熱，此時必須使散熱減少到最低限度或外加熱方能使體溫恢復至正常。體溫低於22℃時，不可能恢復，機體對環境溫度處於無反應狀態。
不論足月兒或早產兒身體受寒冷刺激，都可產生皮膚血管收縮反應。皮溫在35℃以上時，這種收縮作用最強，降到35℃以下時，血管由收縮變爲擴張，並伴有液體滲出。寒冷刺激引起的周圍血管收縮反應可增加體內深部組織的保暖作用，但新生兒這種保暖作用有限，在寒冷刺激較強或持續時間較長時，散熱大於產熱，體溫便降低。
新生兒在環境溫度降至中性溫度以下時，機體產熱增加，但不能通過增加肌肉活動(寒戰)來增加產熱，主要是增加氧耗提高新陳代謝率來代償性產熱，生後頭幾天內這種代償性產熱並不充分，當寒冷刺激強烈時，雖代謝增加，仍不能維持體溫，便形成低體溫。
新生兒產熱的主要部位在棕色脂肪，棕色脂肪中脂肪酸的代謝分解，需要有完善的神經系統功能和充分的氧供應。新生兒在缺氧和神經系統功能障礙時，棕色脂肪不能利用，化學產熱過程常不能進行，易出現體溫不升。新生兒患敗血症、肺炎等感染性疾病時，由於進食減少，熱量攝入不足;因休克、酸中毒和微循環障礙等影響棕色脂肪分解，使體內產熱減少，此時如環境溫度偏低，保暖不夠，嬰兒很易引起低體溫。
