手足口病是由腸道病毒引起的，而引發手足口病的腸道病毒有20多種(型)，其中以柯薩奇病毒A16型(Cox A16)和腸道病毒71型(EV 71)最爲常見。“患者之前可能感染了柯薩奇病毒A16型而患有手足口病，之後體內已經有了柯薩奇病毒A16型的抗體，但並不表示患者今後就不再患有腸道病毒71型的手足口病。
兒童手足口病並不是終身免疫的。曾經患過手足口病的患者仍然有可能會連續兩次或三次患上手足口病，即使當季得過後也仍有被傳染髮病的可能。因此，家長不能掉以輕心。
兒童手足口病高發季節大約爲每年的4月—7月，在5月、6月達到最頂峯，隨後慢慢減少。暑假也處於手足口病的流行季節，但一般不會大面積爆發。於手足口病的流行季節，但一般不會大面積爆發。
家長日常對孩子的親密舉動是有可能傳播小兒手足口病病毒的。因爲引起手足口病的是腸道病毒，會通過糞口途徑及接觸傳播，還可經接觸病人皮膚、黏膜皰疹液而感染。如果患者便後不洗手或者患手足口病的孩子的大便沒有處理好，病毒可能就會被帶到環境中，通過親密的接觸，就有可能把病毒帶給其他孩子
手足口病以接觸傳播爲主要傳播方式，尚無疫苗預防。因此養成良好的個人衛生習慣是預防手足口病的關鍵，需要家長和兒童做好以洗手爲主的“四個行動”。
一是“洗手行動”。正確洗手是目前防控手足口病最簡便有效的健康干預。家長在接觸兒童前，處理糞便、嘔吐物或更換尿布後都要用肥皂或洗手液及流動的水洗手;外出歸來、飯前便後都要給兒童洗手。
二是“清洗行動”。要及時清洗、曝曬或消毒尿布，勤曬衣被;經常清洗、消毒兒童使用餐具、奶瓶、奶嘴、玩具和其他物品;可用高溫(>56℃)、漂白粉或紫外線照射進行消毒。
三是“開窗行動”。經常開窗通風，保持室內空氣清新。
四是“保護行動”。做好自我保護。幼兒在手足口病高發季節儘量少去人多擁擠的公共場所，到醫院看病時儘量戴口罩。
