棉質尿布在準備使用前，無論新舊，都需要經過清洗。使用過的尿布在清洗之前要儘可能除去上面的糞便，清洗時可以用中性洗滌劑，但最好使用洗滌嬰兒用品的專用皁液。可以在使用5～6次後對尿布進行一次消毒處理。
但如果新生嬰兒患有腹瀉等消化道疾病或皰疹等皮膚病時，則對每次換下的尿布都應進行消毒。在對尿布進行消毒處理時，需準備一個消毒專用的塑料桶，將尿布放入桶內，倒入適量清水和專用的消毒液，至少要在消毒液中浸泡6小時以上。
每次清洗尿布時一定要漂洗乾淨，不要殘留洗滌劑或消毒劑，否則不僅會降低尿布的吸水性，還會傷害新生嬰兒嬌嫩的皮膚。沖洗乾淨後的尿布需要在通風處晾乾曬透，最好經過太陽曝曬。
