精液常規檢查能查出男性精子的色、量、液化時間、酸鹼度、精子計數、活動力、存活率及形態等，是確診男性少精必須做的檢查項目。
當男性3次精液常規檢查結果都是精子密度低於2000萬者，可確診爲少精症。
少精症患者還需要注意做體格檢查，包括全身及生殖器官檢查。
全身檢查要特別注意檢查發育、營養及精神狀況，生殖器檢查內容主要包括前列腺、陰莖、睾丸、尿道、精索等部位的檢查。
染色體異常也是導致男性少精症的病因之一，所以少精症患者還應進行染色體檢查，確診是否是染色體異常所致。
一般來說，精子密度低於1000萬/毫升的患者，都應做染色體檢查。另外，Y染色體上與生精有關的基因-無精子因子有微缺失時，也會導致患者出現嚴重少精子甚至無精子。
內分泌異常也是導致男性少精症的原因之一，做內分泌檢查可幫助排除或確診病因。
內分泌檢查是通過刺激試驗可以瞭解下丘腦-垂體-睾丸軸的功能，測定睾酮水平可以直接反映間質細胞的功能。
通過超聲檢查可診斷男性少精是否是精索靜脈曲張造成的，若確診常用手術治療。
