子宮腺肌症不一定切除子宮。子宮腺肌症的治療要根據年齡、症狀、病變部位和範圍以及對生育要求等加以選擇。
有慢性盆腔痛、經期痛經症狀明顯、有生育要求及無卵巢囊腫形成的，可以行藥物治療。
手術治療主要適用於藥物治療後症狀不緩解、局部病變加劇或生育功能未恢復者、較大的卵巢內膜異位囊腫者。手術的方式有保留生育功能手術、保留卵巢功能手術和根治性手術。保留生育功能手術是切淨或破壞所有可見的異位內膜病竈、分離粘連、恢復正常的解剖結構，但保留子宮、一側或雙側的卵巢，至少保留部分卵巢組織。保留卵巢功能的手術是切除盆腔內病竈和子宮，保留至少一側或部分卵巢。根治性手術是將子宮、雙附件及盆腔內所有的異位內膜病竈予以切除和清除，主要適用於45歲以上的重症患者。
經宮腔操作
剖宮產、診斷性刮宮、人工流產或分娩等，經宮腔的操作或手術可能會促使子宮內膜侵入子宮肌層。
子宮內膜炎症
慢性子宮內膜炎與腺肌病發病密切相關。
其他
合併子宮肌瘤。
子宮腺肌症的治療，應該根據患者的症狀、年齡和是否有生育要求而制定。
目前沒有根治性的有效藥物，一般對於症狀較輕、有生育要求以及臨近絕經期的患者，可以用達那唑、孕三烯酮、宮內放置曼月樂或GnRH治療，這些都可以緩解症狀，但是需要注意藥物的副作用，並且停藥以後，腺肌病疾病的症狀還會再出現。
年輕或者是有希望生育的子宮腺肌瘤的患者，可以行病竈切除術，但是術後有復發的風險。對於症狀較重，而且又沒有生育要求的，或者是藥物治療無效的，應該行全子宮切除術，對於是否保留卵巢應該取決於卵巢有無病變和患者的年齡。
