寶寶腦發育不良症狀最常見的就是智力障礙，所有腦發育不良的寶寶中，患有智力障礙的多達四分之三。智力輕度、中度不足的約佔1/2，重度智力不足的約佔1/4。知覺障礙：大部分患者對刺激過敏或無反應;有的出現知覺固定，背景和圖形紊亂。
寶寶腦發育不良第二個典型症狀就是聽覺和視力的障礙，很多與近視有關的兒童或斜視，這是超過了斜視。聽力喪失在手、手、腳、手、腦發育更爲常見。大腦發育的孩子往往很難辨認出聲音的節奏。
除了智力方面的障礙，腦發育不良的寶寶身體的生長髮育也更加遲緩甚至畸形。比如姿勢障礙、運動障礙等都是腦發育不良寶寶的典型症狀。一部分輕型腦發育不良兒童生長髮育可以基本或接近正常，但大多數的腦發育不良兒童都比同年齡的正常孩子個子長得矮小，生長髮育顯得落後。
腦發育不良寶寶可能同時會出現幾種障礙，除了運動發育障礙、智力障礙等，最常伴隨的就是語言發育障礙。除了大多數腦發育不良兒童可能伴有不同程度的語言障礙，有的表現爲語言表達困難或構語困難，有的表現爲發音不清或口吃，有的還表現爲失語症，即能理解別人的語言，但自己無法講話，這種情況尤其以手足徐動型的腦發育不良佔比例爲大。
