乳糖酶沒什麼副作用。
乳糖酶，別名：β-半乳糖苷酶，主要作用是使乳糖水解爲葡萄糖和半乳糖。主要用於乳品工業，可使低甜度和低溶解度的乳糖轉變爲較甜的、溶解度較大的單糖;使冰淇淋、濃縮乳、淡煉乳中乳糖結晶析出的可能性降低，同時增加甜度。
1、早期乳糖不耐的嬰幼兒會產生吐奶、腹瀉、便祕、腸鳴、腹脹、腹痛、排氣、等問題.易產生哭鬧等現象，乳糖不耐得不到及時治療會造成嬰幼兒厭奶，影響其生長髮育。
2、乳中含有人體骨骼、肌肉、器官、大腦等生長髮育必不可少的微量元素.因乳糖不耐無法吸收奶中營養扣厭奶的嬰幼兒一般部會出現營養不良的各種症狀。
3、乳在乳糖酶作用下形成的半乳糖是寶寶大腦發育必不可少的物質、長期乳糖不耐影響嬰幼兒大腦智力發育。
4、同時，由幹乳糖不耐，喝奶後，奶在嬰幼兒體內無法被完全分解、消化、吸收滯留在腸腔內，在細菌的作用下形成各種有害物質。引起腸道菌羣失調。引發腸胃問題，長期乳糖不耐易導致小兒難治癒的慢性腹瀉;部分患兒會誘發尿布疹。
5、乳糖不耐影響奶中的各種礦物質的吸收。比如鈣、鐵、磷的吸收。造成寶寶缺鈣、缺鋅、缺鐵和貧血症狀等。
6、乳糖不耐也會造成奶中維生素、蛋白質等嬰幼兒生長髮育必須物質難以被患兒消化、吸收。適成患兒體重低下及生長髮育遲緩等問題.嚴重的時候，乳糖不耐誘發的併發症會危及患兒生命。
乳糖酶不可以長期吃。
如果確診是乳糖酶缺乏導致的拉肚子的話，纔可以吃乳糖酶來幫助乳糖的吸收。一般小嬰兒體內乳糖酶含量大多都不低，真正乳糖不耐受的嬰兒還是極少數的。
