大部分先天性心臟病是可以通過長大以後的後續治療治好的，也有的先天性的心臟病既然是治療也無法痊癒的。對於嬰兒出現有先天性心臟病的情況及時治療，會延長患兒的生命。
一般來說，大部分的先天性心臟病通過手術或是藥物可以改善的。在孩子小的時候，一般採用保守治療，等到長大後再接受手術治療。 隨着技術的進步，目前不能治療的先天性心臟病以後可能會有治療方法，患有先天性心臟病應及時就醫，聽從醫囑。
先天性心臟病確切的致病因素還不很清楚，但專家普遍認爲，母親懷孕期間，尤其是懷孕頭三個月內暴露於一些不良因素與先心病的發病有密切關係，這些不良因素包括：病毒感染、接觸放射線、吸菸、酗酒、服用某些藥物，如：安眠藥、抗癌藥和治療糖尿病的藥物，懷孕媽媽患代謝性疾病，如：糖尿病、高鈣血癥和苯丙酮尿症等，營養物質如葉酸等缺乏以及患有引起子宮和胎盤缺氧的慢性疾病等。
而新近觀點認爲，懷孕前3至6個月暴露於這些因素也可能增加先心病發病風險。近幾年來，科學家發現，遺傳因素在先心病發生過程中也扮演着重要角色。研究顯示，如果直系親屬患先心病，胎兒患先心病的危險性增加5至6倍。
1.動脈導管未閉：6個月~1歲，導管已無自行閉合可能，可擇期手術治療。
2.繼發性房間隔缺損：最佳治療年齡爲5歲一下，如果分流量較大，右心負荷加重，可將年齡提前到1~2歲。
3.室間隔缺損：爲最常見的先天性心臟病，直徑小於0.5cm的在1歲以內自發變小或癒合的可能性大，大多無需手術。自發閉合率在6月內最高，之後逐漸降低，3~4歲以後癒合可能性很小。對室缺伴症狀患者，肺動脈壓力增高，應早期手術，在1~2歲以內爲好。如合併心力衰竭、肺炎、發育遲緩、餵養困難等情況，應及時手術。如果是肺動脈瓣下室間隔缺損，容易累及主動脈瓣，因此一旦確診即應手術。
4.法洛四聯徵：隨着技術的提高，手術時機已不受年齡限制，症狀較輕的患者可於1~2歲時擇期手術。
5.主動脈縮窄：縮窄兩端壓力階差超過4kPa則具備手術適應症。對無症狀的患兒，可在4~6歲進行手術；一旦出現心力衰竭徵象或血壓過高，則需提前手術。
6.主動脈弓中斷：若不治療，75%的患兒可在出生後1周內死亡，因此一旦明確診斷、代謝復甦後需儘快手術。
7.左心發育不良綜合徵：一般需進行3期手術。一期Norwood手術出生後1周內進行，二期Gleen手術在術後6~12月進行，三期Fontan手術在二期術後6~12周進行。
