百日咳是一種百日咳桿菌引發的傳染性呼吸道疾病，在百日咳桿菌生長繁殖的過程中產生一種內毒素引發的。
主要原因：
1、內毒素：百日咳桿菌可在呼吸道纖毛上生長繁殖，這個過程中它分泌出一種叫內毒素的有害物質。該物質是造成纖毛損傷的“元兇”。
2、炎症：呼吸道粘膜發炎，一方面產生了大量粘性的分泌物，這些分泌物對纖毛有傷害;另一方面這些分泌物會刺激呼吸神經的末端，給大腦皮層的咳嗽中樞發出信號，激發咳嗽。因此即使病勢有所恢復，嬰兒哭鬧仍可能會使舊病復發。
其它原因：
1、未注射疫苗：嬰兒未能及時注射疫苗，或因爲顧忌疫苗的副作用而不願意注射疫苗。
2、病菌耐藥性：病原菌的耐藥性使得疫苗的作用下降甚至完全消失。
3、其他病原菌：如副百日咳桿菌等，也可能發病。
寶寶得百日咳期間，如果家長沒有做好防護工作，和寶寶親親或者接觸到了寶寶的口水就容易傳染，雖然說大人的抵抗力比小孩強，但是在疾病期間也要做好防護工作。
百日咳的傳播途徑主要通過咳嗽時飛沫傳播，在病人周圍約2m以內都有吸入病菌的可能。百日咳桿菌在體外很快死亡，所以，很少通過衣物、用具等間接傳播。所以百日咳的病菌是會通過唾液傳播的，只要家長能夠避免接觸孩子的唾液就不會被傳染的。
百日咳是有預防疫苗接種的，一般是百白破疫苗，是能同時預防百日咳、白喉和破傷風三種疾病的，接種了百白破疫苗就能減少嬰幼兒百日咳的患病機率。
正常情況下是在三個月的時候打第一針，四個月時打第二針，五個月大時再注射第三針。寶寶在1歲半到2歲期間，還要注射百白破加強針。
