百日咳期間，醫生會開一些抗生素的藥物給寶寶吃，能幫助寶寶控制病情，主要藥物有紅黴素、阿奇黴素和羅紅黴素。
1、紅黴素
病原菌高度敏感，此爲首選。劑量：30-50毫克/公斤/日。給藥途徑：口服或靜滴。療程：一週到兩週。
2、羅紅黴素
與紅黴素同爲大環內酯類抗生素。劑量：5-10毫克/公斤/日(分2次使用)。給藥途徑：口服。療程：一週到十天。
3、阿奇黴素
第二代大環內酯類抗生素。劑量：10毫克/公斤/日。給藥途徑：口服。療程：3天。
羅紅黴素與阿奇黴素的口服效果好、對消化道刺激小，可以根據患兒情況酌情使用。
百日咳因爲病程能達到一百天，所以就叫百日咳，它是一種自限性疾病，做好護理工作是能夠自然痊癒的。
但是因爲小孩子抵抗力低，如果不進行人爲干預，比如看醫生、吃藥等處理，容易引起嚴重的併發症，加重寶寶的百日咳病情，甚至容易引發嚴重的後遺症，所以小孩得了百日咳，家長一定要及時治療，減少病程，讓寶寶能快點痊癒。
百日咳是有預防疫苗接種的，一般是百白破疫苗，是能同時預防百日咳、白喉和破傷風三種疾病的，接種了百白破疫苗就能減少嬰幼兒百日咳的患病機率。
正常情況下是在三個月的時候打第一針，四個月時打第二針，五個月大時再注射第三針。寶寶在1歲半到2歲期間，還要注射百白破加強針。
