夫妻一方出現染色體平衡易位容易導致胚胎出現染色體異常從而造成胚胎停育。其導致胚胎染色體異常的機制爲夫妻染色體交融時易產生染色體片段丟失或重複，從而導致受精卵染色體異常而不能正常發育，可導致流產、死胎、畸形兒。精子DNA的完整性也與精子功能有顯著相關性，並且可以影響受精卵的分裂以及胚胎的發育。儘管精子DNA碎片率高可能並不影響卵子受精，但可能容易導致胚胎髮育不良和流產。亦即，精子DNA損傷嚴重的患者，即使可使卵子正常受精、分裂，但最後仍然可能導致流產。
感染所致孕早期流產愈來愈受到國內外學者的重視。研究發現，母體發生感染後病原體可通過血行使胎盤感染，引起絨毛膜和毛細血管內皮受損，破壞胎盤屏障，病原體進入胎兒導致流產、胚胎停止發育及胎兒畸形。而母體所發生的感染也可能來源於男性，比如生殖腺體感染和炎症(附睾炎、睾丸炎、前列腺炎或精囊炎等)。
從男性角度來講，體內有抗精子抗體、精子質量差、畸形率高，愛人懷孕前自己接觸了有毒物質，受到放射線或大量電磁輻射的照射，吸菸或者酗酒等，都可能造成胎停育。
胎停育的原因很複雜，治療起來也比較困難。如果出現胎停育，建議男方也應到醫院接受正規的檢查，例如精液質量檢測、抗精子抗體檢測、有關酶類檢測、染色體核型分析等。女方同樣需要進行詳細的檢查，再根據雙方結果做必要的治療。不建議在發生胎停育後，夫妻雙方未經任何治療即再次生育。與此同時，男性應該改正不良生活習慣(吸菸、吸毒、酗酒和熬夜等)，調節工作壓力和提高睡眠質量;避免長期暴露於高溫、污染的空氣、毒物和放射線暴露等有害環境。然後，在專業男科醫生的指導下，治療相關身體疾病，以助於成功生育健康的寶寶。
