不管是人工流產還是自然流產，對女人都有危害。
人工流產的併發症有：
術時併發症：子宮出血在200毫升以上；人流綜合徵又稱心腦綜合徵，發生率12%，受術者突然出現心動過緩，心律失常，血壓下降，面色蒼白，大汗淋漓等一系列症狀，嚴重者甚至發生昏厥和抽搐；子宮穿孔；漏吸，胚胎組織未能吸出，以至妊娠繼續發展。
近期併發症：人工流產不全，術後陰道出血長達15天以上；術後 2周內由於致病菌的感染而出現子宮內膜炎，附件炎，盆腔炎等；宮腔積血；宮腔粘連，術後閉經或經量顯著減少，有時伴週期性下腹疼痛或有子宮增大積血。
遠期併發症：慢性盆腔炎；月經異常；繼發不孕；子宮內膜異位症。
再次妊娠時的併發症：不孕症；晚期流產偏高；早產偏高；圍生期死亡率偏高；產前、產後出血率增加；新生兒溶血癥增加。
藥物流產適用於停經49天內的婦女。國產米非司酮的不全流產和流產失敗率約10%；藥物流產的副作用有噁心，嘔吐，頭暈和乏力等類早孕反應，下腹痛明顯增高；藥物流產後出血時間長，平均爲半個月左右，有的長達1-2個月之久，並有潛在大出血的危險；在進行藥物流產中，部分孕婦停經在40天之內，此時臨牀難以確診是宮外還是宮內妊娠，因此有時誤診而使用藥物流產，以後發生內出血休克需要搶救。
藥物流產只能是避孕失敗的補救措施之一，絕不能以藥物流產當作避孕措施。
