出生就可以吃，合生元益生菌不超過一週的寶寶每天一袋，早上服用。大一些的寶寶需要飯前或放在輔食中服用，一早一晚，每次一小包，注意水溫不能超過37度，隨衝隨喝。如果寶寶用了抗生素類藥物，需間隔至少2小時才能喝。
滿月就可以吃，合生元的益生菌沖劑（兒童型），由嬰兒雙歧桿菌、兩歧雙歧桿菌和嗜酸乳桿菌組成，都是有益菌，益生菌的作用很多1. 全面提高嬰幼兒自身抵抗力2. 激活機體免疫系統 3. 排擠抑制有害菌4. 提高營養吸收能力5. 分泌抗體IgA維生素。
合生元益生菌不建議長期服用雖然合生元益生菌對免疫力低下的寶寶的確是個不錯的產品，但是如果寶寶長期吃的話， 可能會形成依賴，不利於寶寶腸胃消化吸收功能的完善，干擾寶寶腸胃發展的步驟。
隨着寶寶長大，寶寶身體裏的有益菌羣也在發展壯大中，若是一直給寶寶餵食合生元益生菌，寶寶體內益生菌足量了，那麼多餘的益生菌是隨着便便排出體外的，反而影響寶寶腸胃消化吸收功能。
每一個寶寶的具體情況不同，需要使用合生元益生菌的時間長短自然會存在差異性，值得注意的是儘管合生元益生菌不是一個藥物，但是最好也不要長期性的進行使用，當寶寶的腸道功能回到正常狀態時，就可以考慮慢慢停止給寶寶吃合生元益生菌了。
