有研究表明，大約有20%的脣裂胎兒是遺傳所致，若是準爸媽的直系或旁系親屬中有類似的畸形發生，那麼就要注意了，一定要做好四維彩超檢查，提前做好心理準備及應對措施。
孕期準媽媽出現呼吸道感染或者風疹等疾病，也是誘發胎兒脣裂的原因之一。這可能是病毒造成的遺傳基因突變，也可能是在疾病治療時用了激素或抗腫瘤藥物、抗組胺的藥物等所致。
懷孕期間，準媽媽因嚴重的嘔吐、厭食、偏食等原因導致維生素A、E、葉酸、鐵、鈣等的缺乏也可能導致胎兒脣裂。有動物實驗表現，給孕期小白鼠餵養缺乏維生素A、E的食物時，生出脣裂(齶裂)幼鼠的機率大。
因此準媽媽飲食一定要均衡營養，多注意各種維生素和營養物質的補充，不能挑食偏食。
準媽媽在懷孕期間，尤其是孕早期時，接受過大劑量X線照射，也容易導致胎兒脣裂。
孕期準媽媽經常出現憂慮、焦急、以及暴躁、恐懼等不良情緒，會導致腎上腺皮質激素阻礙胚胎的某些組織的融匯，也是造成胎兒脣裂或是齶裂的一個重要原因。
1、做好孕前檢查
脣裂爲多基因遺傳性疾病，因此在懷孕之前，準爸媽就應做好全面謹慎的孕前檢查，如有一方，甚至雙方患有此病，或有家族病史，胎兒患病的機率就會很高。
2、孕期多加註意
懷孕期間，準媽媽飲食要均衡營養，不挑食偏食，要注意預防風疹等病毒感染，不服用抗腫瘤藥物，抗驚厥藥，組胺藥等藥物。另外平時要學會控制自己的情緒，少想不開心的事情，並且日常生活中要注意不抽菸酗酒或接觸放射性物質。
3、有糖尿病、貧血、婦科病及甲狀腺功能減退疾病的孕婦，要儘早治療。
