首先女性應先去去醫院檢查確診懷孕，並超聲檢查確定孕囊的位置，同時通過上次月經時間計算懷孕時間。宮內孕且懷孕時間不超過49天的，白帶常規，血常規，出、凝血檢查結果都正常的，可以藥流。
醫生會給開米非司酮、米索前列醇兩種藥，頭2天可在家服用米非司酮，1天吃2次，早上吃2片，晚上吃1片。第3天早上空腹去醫院服用米索前列醇3片，服藥後大概20分鐘左右，就會出現下腹部疼、陰道出血的情況，這期間一定要仔細觀察陰道排出物，直到孕囊排出，疼痛減輕再觀察半小時左右就能出院回家休養了，整個過程大概需要2-6個小時。
藥流時孕囊脫出來時可看到是一坨像肉或棉絮樣的東西，跟血塊有明顯的區別，用水沖洗發現其越來越白。
這時候應看看其是否完整，有沒有絨毛結構，若有說明藥流成功了。若無說明沒流乾淨，需要複查B超，看看孕囊是不是還在宮腔內，是否需要清宮。
藥流的女性服用米索藥物後大概2-6小時可見到孕囊排出，之後還會有少量的蛻膜或者是血塊排出，會陰道流血一段時間，約一週左右能流乾淨。
若之後陰道流血時間超過1周還沒幹淨，可懷疑藥物流產不全或者有妊娠囊殘留物，應就醫做超聲複查，確診有殘留的需要再行清宮處理。
