胎兒頭顱磁共振檢查整個過程大概要30分鐘，這期間孕媽媽只要認真配合醫生的指示做就好，其結果有醫生判斷。檢查前孕媽媽應注意下列事項：
1、孕早期的媽媽不能做磁共振檢查，因爲其熱量和噪音會影響胎兒發育。孕28周前也不用磁共振檢查，因爲此時超聲檢查效果更好。
2、檢查前，孕媽媽應去除身上所有金屬物品及電子產品，帶金屬掛鉤或鋼圈的內衣也要去掉，以免影響檢查結果。
3、檢查時，一般孕婦是平臥的，如平臥耐受不了的，也可以取舒適的臥位姿勢，如仰臥位或側臥位。
4、若檢查時孕媽媽有心慌、憋氣、恐懼乃至無法忍受等不適，應立即要求停止掃描。
孕中晚期時做胎兒頭顱核磁共振是沒有危害的。這是一種綠色的對人體無害的高清檢查方式，它可以準確的顯示胎兒頭顱情況，比如頭部骨頭鈣化情況等，有病變能很好的看到，是對超聲的有力補充。
其準確率可達90%以上。
孕晚期胎兒腦部有異物出現，這時候超聲檢查不能確診，做頭顱核磁共振檢查，其準確率通常可以達到90%以上，只是由於隔子宮，準確率不能百分百。通常磁共振檢查結果表示胎兒腦部異常，大多都要引產終止妊娠。
