一般來說遵醫囑正常使用肝素是沒有副作用的，反而可保胎預防反覆流產。但若是劑量不對，就可能出現自發性出血問題，比如各種粘膜出血，關節腔的積血和傷口出血等，這是因肝素誘導血小板減少所致，如果出血較多會增加流產等風險，所以肝素一定要遵醫囑正確使用。
1、有複發性流產，或免疫性疾病的孕婦，早期可使用肝素進行保胎治療。
2、在孕前或者孕早期，檢查發現有血凝障礙問題，D二聚體值升高，孕期由於各種抗體，聚集在子宮當中，使胚胎不能很好地吸收營養，導致胚胎髮育停止等情況時，也需要用到肝素預防型保胎治療。
孕期需要打肝素來保胎的，每個患者用藥時間都不同，要因人而異。
一般只有部分孕婦因檢查發現有血凝障礙問題，影響到了胎兒發育時才需要打肝素來保胎，通常使用5000個單位肝素進行皮下注射，每天1-2次，至於停止用藥的時間要則要根據抽血檢查結果決定，當發現凝血這一項數值結果正常了時，就可停止用藥，所以說用藥時間要因人而異。
