發生率1%~2%，可損害心臟瓣膜，是布魯氏菌病最嚴重的併發症之一，也是布魯氏菌病患者死亡的主要原因。
表現為關節腫痛和僵硬，膝關節、股關節、踝關節、腕關節和脊柱關節最常受累，其中脊柱炎治療難度較大，炎症持續存在可影響脊柱功能。
布魯氏菌侵入男性生殖系統後，可導致附睪睪丸炎，主要症狀表現為睪丸腫痛，這在男性患者中並不少見，，多為單側。
2%~7%的布魯氏菌病會發生神經系統受累，表現為急慢性腦膜炎、腦膜腦炎、脊髓炎或多發性神經根神經病。布魯氏菌病引起的腦膜炎與結核性腦膜炎的腦脊液表現類似，腦脊液病原學檢查可協助證實。
布魯氏菌病可造成多種面板損害，包括皮疹、結節、丘疹、結節性紅斑、瘀點、紫癜。面板潰瘍、膿腫、化膿性淋巴管炎則常出現於豬種布魯氏菌感染。偶爾出現鼻出血、牙齦出血、血尿、面板紫癜，這是由於脾功能亢進、骨髓吞噬作用和(或)抗血小板抗體導致血小板急劇減少。
其他少見的全身併發症還包括肝炎、肺炎、胸膜炎、皮疹、葡萄膜炎等。
