精囊炎是一種炎症感染性疾病，所以治療時常用有抗菌消炎作用的抗生素類藥物治療。
常見的抗生素類藥物有：氧氟沙星、左氧氟沙星、頭孢克肟、青黴素、紅黴素等。
精囊炎患者還可用黃連素灌腸治療，這樣可改善局部血運，助炎症消退。
具體用法：大便後用1‰黃連素20毫升灌腸，用此藥浸溼紗布墊置於會陰部，並連接在直流電理療器的陽極上，陰極敷於恥骨上，每次20分鐘，每日一次，每10次一個療程。
精囊炎患者在病情比較嚴重的時候，或者疾病處於慢性期時，還可結合中藥以及物理療法一起治療，只要患者針對性治療就能很快徹底治癒疾病。
比如用一些具有消炎補腎作用的中成藥物，比如：銀花泌炎靈片、消炎利尿藥丸以及知柏地黃丸等。
物理療法包括：離子透入、熱療等等。
