一般來說，經過及時正規治療後是不會出現後遺症的。
附睾炎其實就是一種炎症，只不過發生部位有些特殊，是在貯存和輸送精子的附睾上，這樣就讓患者很擔心。但其實只要患者一患病，就及時去醫院經受正規的治療，是能徹底治癒，不會留有後遺症的。但如果治療不及時，或久治不愈就可能引發一些後遺症。
1、影響精子質量
附睾被病原體感染後，可能會對附睾中的精子造成損害，比如影響精子的活動度、導致精子凝聚，影響精子活力，甚至是殺死精子，引起死精等，從而影響男性生育能力。
2、導致男性不育
急性附睾炎反覆發作，引起慢性附睾炎是，炎症就可能導致疤痕組織而阻塞到附睾管，從而影響精子排出，導致男性無精，最後導致不育症的發生。
3、引起其他疾病
如果是由於病菌引發的附睾炎，如果治療的不及時還會引發其它疾病，如精索靜脈曲張、靜索炎、前列腺炎、內分泌疾病等，嚴重危害男性朋友的身體健康。
1、抗菌治療
附睾炎的抗菌治療首先應該根據細菌培養和藥物敏感試驗來選用合適的抗菌藥物，如檢查結果未出時，可暫選用喹諾酮類，待藥敏結果出來後再酌定。
2、止痛治療
急性附睾炎發病早期腫痛症狀嚴重，可以用利多卡因加地塞米松行封閉治療，可以在短時間內使症狀緩解，並可促進炎症包塊的吸收。
3、手術治療
少數情況下需行手術治療，如附睾炎在一般治療後症狀沒有好轉或加重;睾丸或陰囊壁膿腫需切開引流減壓;睾丸和附睾因炎症播撒導致缺血缺氧症狀嚴重，有可能影響功能時可考慮手術治療。
