小兒肥胖有可能會導致高血壓心臟疾病以及冠心病的發生，這主要是因爲小孩身材過於肥胖，身體內會儲存大量的脂肪，身體代謝後氧量也會有所增加，增加心輸出量。從而引起動脈粥樣硬化和心肌肥厚的發生，進而導致高血壓的出現。除了容易誘發高血壓之外，還有可能會引起腦血管疾病以及心絞痛的發生。
小兒肥胖還有可能對肝臟造成一定的影響，這主要是因爲小兒肥胖肝臟需要分解過多的脂肪，肝臟不堪忍受如此重任，很容易引起肝臟功能失調的發生。從而導致肝細胞內聚集大量的脂肪，進而引起細胞變性以及肝功能異常的發生。據有關數據表明，肥胖的兒童還容易出現不同程度的脂肪肝。
小兒肥胖不僅對患者的外在形象造成一定的影響，而且還有可能對患者的智力造成一定的影響。這主要是因爲肥胖兒童體內脂肪比較多，少量的血液存在於四周組織中，有效呼吸會相應的減少，使心腦處於缺氧的狀態，對智力造成一定的影響。
