1、寶寶出生後，其免疫系統發育不成熟，除母乳蛋白外，免疫系統會把部分動物蛋白和植物蛋白當成異種蛋白，這些蛋白質通常分子量比較大，容易剌激寶寶的免疫系統作出過強的反應，出現如胃脹氣、腹痛、腹瀉等。
2、嬰兒對於牛奶不耐受分爲兩種情況：
1. 乳糖不耐受。新生寶寶腸道內的乳糖酶不足，不能很好地分解配方奶中的乳糖，致使乳糖進入結腸，被細菌分解產生很多氣體，同時吸收很多水分，就會出現腹瀉。
2.牛奶蛋白過敏。新生寶寶腸粘膜發育和腸道菌羣不成熟時添加配方奶粉，可能會誘發牛奶蛋白過敏。醫生建議，給新生寶寶添加配方奶粉時，可優先選擇部分水解蛋白配方。
3、及時換奶：可以嘗試將奶粉換成部分水解蛋白配方奶粉，例如美贊臣親舒易消化乳蛋白部分水解配方粉。部分水解蛋白配方中的蛋白質已預先被分解成微細分子。在進入嬰兒幼嫩的腸胃後，降低引發激烈反應的機會。
4、臨牀研究證實，美贊臣乳蛋白部分水解配方能在24小時內有效減輕多種消化不適。
5、專家建議採用美贊臣親舒易消化乳蛋白部分水解配方粉，100%荷蘭原裝原罐進口,擁有先進的水解蛋白技術及低乳糖技術, 可有效減少寶寶對於牛奶及乳糖不耐受現象。同時臨牀驗證水平的DHA/ARA，可爲0-1歲新生寶寶提供全面均衡的營養，有助寶寶每日DHA攝取量達到聯合國糧農組織和世界衛生組織建議水平，在寶寶腹瀉等消化不適症狀得到緩解後，仍可長期食用，幫助寶寶更好的吸收營養，健康成長。
吃母奶的嬰兒，大便多呈現鬆軟，量多，且次數亦多，幾乎每次吃奶或每隔一小時就排便一次，但大便顏色正常，略帶酸味，寶寶食慾佳，體重穩定增加，因此這樣的現象並不能稱爲腹瀉。至於吃配方奶的嬰兒，大便會較吃母奶的硬，若發現怎麼大便的水分突然增多了，顏色改變或帶有黏液，大便次數亦增加，但體重並沒有增加或甚至減輕，那寶寶可能是拉肚子了。
服食嬰兒腹瀉奶粉是較簡單的治療先天對牛奶蛋白或乳糖過敏的腹瀉嬰兒的方法。由於這些奶粉在營養上與其他嬰兒奶粉並無差異，是嬰兒腹瀉期可以放心食用的特殊配方奶粉。現在市面上各大超市都有進口或是國產的不含乳糖的治腹瀉奶粉，大家也可以根據寶寶的腹瀉情況進行對症購買，效果不錯。
先要確認嬰兒是因牛奶蛋白或乳糖不耐受而引起的腹瀉，纔可以食用。在拉肚子時可直接停用原配方奶粉，更換成腹瀉奶粉。待腹瀉改善後，則需以漸進式添加配方奶粉方式進行換奶。腹瀉奶粉不宜長期給寶寶食用，腹瀉症狀緩解後應該逐漸轉到普通奶粉。嬰兒腹瀉情況嚴重的，應及時帶往醫院就診。
一般而言，當腹瀉達一定程度時，會使腸黏膜層受損，降低小腸黏膜酵素(尤其是乳糖酵素)的活性，而無法消化奶水中的乳糖，這些無法被分解吸收的乳糖到小腸的下半部或大腸中，被細菌發酵產生乳酸及二氧化碳，引起腹脹，腹瀉等現象，使寶寶的腹瀉情形更加嚴重。
而且黏膜層爲腸道中的一層天然屏障，可阻止食物中未被消化的蛋白質被吸收，所以當腸黏膜被破壞時，會使奶水中的一些較大蛋白質或過敏塬通過黏膜，進入血流中而引發過敏反應，如此惡性循環的結果將會促使寶寶的腹瀉更難痊癒。
爲避免乳糖及牛奶蛋白繼續進入腸道中，當寶寶有嚴重腹瀉時須暫停餵奶(包括嬰兒奶粉或牛奶)，對症狀較輕的嬰兒可考慮將奶水衝稀一半以減輕奶水對腸膜的刺激。但對六個月內的寶寶，因其以奶水爲主要的能量來源，若持續數天以稀釋奶水餵食，可能會營養不良，所以可考慮試用腹瀉專用奶粉。而1—2歲以上的幼兒，家長不妨改喂稀飯或不含油的食物，不一定要餵食這種特殊配方奶粉。
