我們比較熟知的益生菌的功效便是保護腸道，而事實上不同種類的益生菌效果也會不同，那麼面對不同種類的益生菌該如何選擇呢，下面一起了解一下。
腸道問題選擇這種益生菌
俗稱A菌的嗜乳酸桿菌(LactobacillusAcidophilus)，可以對抗幽門桿菌、沙門桿菌及宋內氏桿菌等造成腸胃感染、發炎，甚至致癌的細菌，同時會分泌乳酸讓腸道保持弱酸性、減低壞菌入侵。不過A菌常駐在小腸，可能會造成小腸細菌過度生長(SIBO)，引發脹氣等問題。
俗稱B菌、比菲德氏菌的雙歧桿菌(Bifidobacterium species)，是一種「一出生就有」的益生菌種，可以附着在腸壁上形成保護膜，避免因爲壓力、食物中毒、感染而發生潰瘍，引發過敏、腹膜炎等疾病。
A、B菌是最常見的保健的腸道益生菌，不過單一使用可能會因爲身體的一些變化，造成菌種無法在腸道內待太久，可以配合存活力最強的凱氏乳酸菌(C菌)、還有乳酸分泌快速的嗜熱鏈球菌(S菌)，讓A、B菌可以在腸道內生存久一點。
這類的益生菌，可以挑選菌株100億以上的品項，服用2週左右就會有成效，這時就可以停下來，如果服用過多，可能會造成D-乳酸中毒，影響大腦功能。
過敏選擇這種益生菌
過敏大家一定會想到要吃LP33益生菌，LP菌是指副凱氏乳酸桿菌(Lactobacillus paracasei)，33則是菌株的編號，是臺灣自己研究、從胃腸道分離出來的菌種;LP菌可以減少發炎反應，讓過敏不要那麼頻繁、嚴重，但目前沒有科學根據顯示能「治癒」。
另一種鼠李糖乳桿菌(Lactobacillus rhamnosus GG, LGG)，經多個研究證實可以降低異位性皮膚炎的產生，但對於治療氣喘、一般過敏完全沒有療效，還可能刺激過敏更嚴重。
不過將LP33、LGG、A、B幾種菌株合併吃，而抗過敏的LP33、LGG菌株至少要20億以上，可以加強菌種在體內定殖的能力，持續8週以上，有機會改變體質，如果超過16週則代表無效;但無論有效無效，仍然需要配合健康的飲食，才能真正改善過敏。
陰道發癢選擇這種益生菌
目前女性私密處感染、發癢的益生菌，比起腸道益生菌來說，有最多臨牀證實是有效用的，也在世界衛生組織(WHO)的會議上發表過;而其中鼠李糖乳桿菌GR-1(Lactobacillus rhamnosus GR-1)、洛德乳桿菌RC-14(Lactobacillus reuteri RC-14)是證實持續服用4周後，可以改善感染的菌種。
雖然鼠李糖乳桿菌GR-1可以有效改善女性私密處感染，但鼠李糖乳桿菌(LGG)本身對這類感染並沒有效用，如果想要購買，一定要仔細看清楚;而如果有在服用抗生素，可能跟這些益生菌產生配合作用，或是抗藥，吃之前最好諮詢醫師或藥師。
