六神丸具有清熱解毒消炎止痛的功效，對於急性咽炎是有一定療效的，但如果是細菌感染引起的，要配合抗生素的使用。
如果與正在使用的其他藥品同時使用時，需要在醫師或藥師的指導下服用。
另外，六神丸可引起藥疹、喉頭水腫等嚴重的過敏症狀，過敏症狀是與劑量無關的，過敏體質者無論是內服，還是外用都要慎用。
1、流行性感冒：成人每次十粒,一天三次,一般服至次日體溫可降至正常,周身乏力等症明顯好轉。若能和用複方氯苯那敏片,則效果更佳。
2、流行性腮腺炎：每次服六神丸五至八粒,一天三次。同時取六神丸十粒研碎成粉末,以食醋調和塗患處,可超過腫脹範圍0.5釐米,用紗布固定,每天換一次,大多3天可愈。
3、蟯蟲病：患兒晚間入睡前,用溫開水清洗肛周,取六神丸五粒納入肛內,再將六神丸十粒用水研磨溶解,塗搽於肛周,連用3～5天即可治癒。
4、軟組織損傷：取六神丸90~180粒研碎,用白酒適量調勻,塗於患處,每天三至五次,約1個星期痊癒。
5、治口腔潰瘍：利用六神丸抗炎、止痛、生肌、收口、抗病毒等功效,外塗治療口腔潰瘍效果良好。
1、六神丸成分之一的雄黃,主要含有硫化砷成分,對肝腎等生命器官有較強的毒副作用。兒童處於發育階段,心肝、腎功能尚未發育完全,若長期大劑量服用六神丸,很容易造成上述器官的功能損害。
2、六神丸在孕早期服用可引發胎兒畸形,孕後期服用易致兒童智力低下等後果。
3、六神丸含有毒藥品蟾酥、雄黃,若過量服用則會引起不良反應。服用過量中毒表現:大量服用六神丸後,在30～120分鐘內可出現噁心、嘔吐、腹痛、腹瀉、頭暈眼花、口脣及四肢發麻、胸悶、心慌氣短、多汗、嗜睡、心律不齊、血壓下降、四肢抽搐、角弓反張、麪灰、口脣及肢端紫紺、黑便、嘔血、急性胃黏膜損害,可因心律失常、驚厥致死。
4、長期使用本品易造成慢性砷中毒。
5、 過敏反應。六神丸過敏反應大多在用藥24小時內發生,多數表現爲藥疹,其形狀各異,皮膚瘙癢,也可呈現全身出血性斑丘疹,或陰囊部丘疹、水皰伴糜爛等。少數表現爲血小板減少。其他表現爲咽喉部黏膜充血水腫;血管神經性水腫;嚴重者出現休克。外用可發生接觸性皮炎。有過敏體質者應慎用。
6、個別出現肝損害及陰莖異常勃起等。
7、新生兒內服中毒致心律失常。
