睾丸扭轉發生後，患者會突然感到陰囊劇烈疼痛，且之後疼痛會隨着陰囊向腹股溝區(大腿根、小肚子兩側)放射。
疼痛的時間要因治療情況而定。
若是睾丸扭轉發生後並及時得到有效治療，治療後痛疼就可以得到明顯的緩解，一般治療之後一到兩天這種疼痛基本上就可以完全緩解。若是睾丸扭轉沒有進行積極的治療，任由它發展，這種疼痛會越來越嚴重，一般在第三天時疼痛達到高峯，之後會出現一個逐漸的緩解。
一般來說，睾丸在扭轉後三分鐘左右，陰囊就會出現劇烈的疼痛感。
睾丸扭轉後，陰囊裏的睾丸、精索血供會出現異常，導致其靜脈血流不能有效的迴流，其代謝產物就會引起劇烈的疼痛，同時由於睾丸扭轉後，精索就會明顯的腫脹，有滲液情況出現。
