蛋殼表面出現肉眼可見的褐色斑點，有的斑點甚至稍微凸起，被稱爲“雀斑蛋”，是因鈣和蛋殼色素分佈不均勻而形成的。
由於蛋殼顏色與雞蛋內物質形成的階段各不相同，因此這類“長斑蛋”與細菌污染並無聯繫，可以食用。
雞蛋蛋殼底部有一種色澤較暗的水印狀斑點或者條帶，看上去也比一般的雞蛋顏色稍暗，叫做“暗斑蛋”或“底斑蛋”。
“暗斑蛋”是雞蛋殼內的水分透過韌性較差的蛋殼膜並積聚在蛋殼附近造成的，也與沙門氏菌污染沒有關係，可以吃。
蛋殼上有很多氣孔，若存放時間過長，細菌、黴菌等微生物有可能會鑽孔而入，擴散到一定程度時，蛋殼表面就會形成斑塊;若斑塊較大，蛋白可能已經被感染。
這樣的雞蛋雖然和沙門氏菌沒有必然關係，但並不安全，不建議食用。
