一般經過積極的治療不會對嬰兒以後有影響，但若是情況比較嚴重，嬰兒吸入過多，炎症反應比較厲害，可能會對嬰兒以後有影響，引起肺動脈高壓，使肺血管阻力增高，右心壓力增加，血液通過尚未解剖關閉的卵圓孔和域動脈導管，在心臟水平發生右向左分流，進一步加重低氧血癥和混合性酸中毒，形成惡性循環，對嬰兒的腦、心、腎等臟器造成損害。
導致血管內皮損害及由此引起的血管內皮源性因子如內皮素、一氧化氮的動態平衡破壞，肺血管收縮性增強，肺動脈壓力增高，是導致肺出血的直接原因，其壓力增高程度與肺出血的預後顯著相關。
是指在圍產期窒息而導致腦的缺氧缺血性損害。臨牀出現一系列腦病表現。本症不僅嚴重威脅着新生兒的生命，並且是新生兒期後病殘兒中最常見的病因之一。
新生兒一般在出生後1分鐘及5分鐘由醫生分別進行兩次Apgar評分。正常新生兒爲滿分10分，評分越低，說明寶寶在出生之前缺氧窒息越嚴重。如：7分以上爲輕度缺氧，往往不影響預後;4-6分爲中度窒息，經積極處理常可在短時間內恢復;少於4分時，呈重度缺氧窒息、呼吸抑制之表現。此時，必須由醫生進行緊急搶救復甦，纔有好轉的可能，否則新生兒很難存活。雖經急救復甦，但出生10分鐘後仍評分很低，尚未建立正常有效呼吸的新生兒，即使倖存下來，由於長時間缺氧，大腦細胞受損，日後可出現智力低下或運動障礙等後遺症。患兒抵抗力低下，還容易出現吸入性肺炎、新生兒硬腫症、低血鈣、低血糖、新生兒顱內出血及周身感染等疾病。
嬰兒出生後，醫生會通過體檢發現一些胎糞吸入的症狀，包括：
症狀之一：呼吸窘迫。表現爲呼吸急促、困難甚至暫停。
症狀之二：皮膚。皮膚顏色並非健康的粉紅色，而呈黃綠色，是胎糞污染所致。
症狀之三：指甲。指甲的顏色也呈現黃綠色，另外妊娠期過長的胎兒指甲會比較長。
症狀之四：羊水。羊水中有胎糞。
症狀之五：阿普加評分較低。膚色、心率、對刺激的反應、肌張力、呼吸這五項的得分在及格以下。
