牙周炎的基本治療需要2至4次門診。第一階段牙周治療包含以下步驟：
牙周囊袋探測
全口X光拍片
口腔衛生指導
牙結石清除
牙根整平術與牙齦下刮除術
某些牙周炎，單靠洗牙、牙根整平無法控制發炎，此時就須要在完成第一階段治療後，在牙周囊袋內放置局部牙周藥膏※註1。
※註1：牙周局部用藥：有些牙周炎，因菌種關係，而不易痊癒。此時，在第一階段治療完成後，在牙周組織內追加局部藥劑，讓抗生素凝膠在牙周囊袋內長期作用，可以顯着改善牙周炎。
牙周囊袋深度超過5mm者，需動小手術將牙齦翻開，針對牙周囊袋底部進行徹底清創。經過深部清創後，若需要重建缺損的齒槽骨，需搭配「骨導引再生手術※註2」;如果是牙周組織有構造上的缺陷，則需視情況採用「牙周整形手術※註3」。以上手術，通常可以在同一次進行。
※註2：骨導引在生手術：已被破壞的牙槽骨，無法靠單純的牙周手術令它再生。因此，破壞範圍太大時，需要進行重建，重建方式是藉由骨粉、再生膜等生物科技材料，植入缺損部位，使組織再生。這就是「導引骨再生術」。導引骨再生術是項小手術，只需使用局部麻醉，手術過程約30-60分鐘。
※註3：牙周整形手術：牙周整形手術，是用來改善牙周組織解剖構造的手術，經常與牙周治療、或人工植牙的療程，搭配進行。
牙周手術後，會進入治療的第三階段–維護期。這段期間大約每隔3～6個月回診檢查、洗牙。範醫師說明，維護期的重點在於加強潔牙訓練，讓牙周組織恢復穩定，並且觀察術後狀況。若經過一段時間的觀察，發現某些牙齒仍未恢復健康，便可確定它們無法挽救。這時候就必須先拔掉，才能進入贗復重建的階段。
嚴重的牙周炎往往會使牙齒脫落，齒列如果缺牙，不僅容易造成口腔機能障礙之外，健康的牙齒也會向缺牙區歪斜傾倒，使咬合平面與咬合高度錯誤，導致顳顎關節障礙。此外，失去功能的齒列會嚴重影響病人的飲食攝取，導致營養不良及免疫力下降。因此缺牙處必須以假牙贗復或人工植牙的方式，恢復咀嚼功能、發音以及美觀。
