1、常溫保存
雪蓮菌一般可以在15℃-20℃的溫度下存活，日常可以將雪蓮菌泡在純牛奶中培育，在空玻璃瓶倒入高於雪蓮菌兩倍的純奶，再加入高於它一倍的水，最後蓋上有透氣孔的蓋子即可，這樣保存20天上下不成問題，注意要放在陰涼乾燥處，不能太陽直射和暴曬。
2、冰箱冷藏
如果是在夏季溫度比較高的情況下可以將雪蓮菌放在低溫冷藏室保存，先用涼開水將雪蓮菌洗淨，然後裝入容器中放入少量純奶，只要能蓋住它們就行，然後將容器用紗布蓋住，放入冰箱冷藏存儲即可。
1、 雪蓮菌不要和其它生肉、剩菜之類的一起存放。如果把雪蓮菌和生肉、吃剩的飯菜放在一塊兒，很容易滋生細菌，並發生串味現象。
2、雪蓮菌必須用玻璃和陶瓷製品盛放。不宜用鐵器及金屬等容器(不繡鋼等耐酸金屬除外)，因爲雪蓮菌鮮奶發酵成酸奶後，呈酸性，有一定腐蝕作用，會和活潑金屬發生化學反應。
3、如果自己出差或長期不在家，最好找熟悉雪蓮菌的人保管看護。因爲雪蓮菌在溫度三四十度時生長較快，發酵也快，要給它們常常洗澡常常換奶，最好一天一次。
4、不能有溼臭和辣味，不能存放在書櫃及太冷、太熱的地方。
