穿心蓮熬水能夠起到解熱解毒的功效，故凡肺肺火引起的病症皆可應用。治外感風熱或溫病初起，發熱頭痛，常與金銀花、連翹、薄荷等同用.治肺熱咳嗽氣喘，常與黃芩、桑白皮、地骨皮合用。
穿心蓮熬水還可用於癰腫瘡毒，蛇蟲咬傷，治癰腫瘡毒，蛇蟲咬傷，可單用，或配、金銀花、野菊花、蚤休等煎服，並用鮮品搗爛外敷，均有解毒消腫的作用。
穿心蓮中所含的新穿心蓮內酯在臨牀上對細菌性痢疾的療效較氯黴素與痢特靈爲優，且沒有副作用和毒性。體外試驗，穿心蓮水煎劑及從其中分離出之粗結晶，均對鉤端螺旋體的某些型別有抑制或殺滅作用，煎劑對肺炎球菌、甲鏈球菌及卡他球菌有一定抑制作用。
藥理研究表明穿心蓮對實驗性炎症有顯着的抑制作用，臨牀上曾應用於多種感染性疾病，包括外傷感染、癤、癰、丹毒、上唿吸道感染、急慢性扁桃體炎、急慢性咽喉炎、急慢性支氣管炎、急性菌痢、急性胃腸炎、尿路感染、子宮內膜炎、盆腔炎、中耳炎、牙周炎等，均有不同程度的療效。
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穿心蓮熬水服用還可以起到保肝利膽的功效，穿心蓮內酯對肝損傷有顯着的對抗作用，能使血清ALT、ASTAKP、SB和肝內甘油叄酯下降。穿心蓮內酯還有顯着的利膽作用。
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