購買後的新鮮平菇可以去蒂後先包一層紙，再放入塑料袋或保鮮膜中保存，可放置一週左右。也可把購買後的平菇去雜質後放在塑料袋裏，在塑料袋上扎幾個孔，放於3℃~4℃的溫度下儲藏，可保鮮7天~10天。
如果平菇的量不多可將平菇放於裝有少量冷水的缸內，並將缸口封嚴，氣溫即便達到15℃-16℃，也可保鮮一週左右。還可將菇完全浸於冷水中，但水必須乾淨衛生，水的含鐵量應低於2毫克/升，這樣平菇纔不會變黑。
新鮮的平菇也可以在沸水中或蒸汽中處理4-8分鐘，放到1%檸檬酸溶液中迅速冷卻，瀝乾水分後用塑料袋分裝好，放入冰箱中冷凍保存，可以保存一個月以上。
如果想要更長時間的保存平菇可以將平菇曬乾後保存，可切成小朵或小片，在日光下曬乾(需時2～3天)或用烘乾機烘乾，過程中要記得翻面;亦可利用真空油炸技術，將其製成即食食品，一般可以保存三四個月以上。
