黑小麥中含有豐富硒元素，硒元素具有防癌抗癌，提高人體免疫力，延緩衰老、清除人體的有毒物質，經常食用有機硒食品可以降低重金屬對身體的毒害，抑制癌症和腫瘤。
黑小麥中所含的天然色素非常豐富，黑小麥中色素屬於花色苷類化合物，屬於黃酮類化合物，具有非常良好的抗氧化和防病治病的作用，如清除體內自由基、抗炎抗腫瘤、預防糖尿病及保護視力等等。
黑小麥中膳食纖維含量很高，大約是普通淺色小麥的2-3倍。在預防心腦血管疾病方面具有積極作用，此外黑小麥中含有大量的不飽和脂肪酸，其中亞油酸和亞麻酸的含量都比較高，它們可以分解人體內多餘的脂肪，也能清理血液中的膽固醇和多種毒素，能軟化血管，加快血液流動，平時多食用一些可以保護血管，減少動脈硬化和血栓等疾病的發生。
黑小麥中含有珍貴的生物活性物質二十八烷醇，。二十八烷醇是醫學界和營養界公認的優秀抗疲勞物質，具有多種重要的生物活性作用，尤其具有極其良好的提高體力、耐力和精力的功效，如提高肌肉耐力和反應敏銳性，增強包括心肌在內的肌肉功能，消除肌肉痙攣和提高能量代謝率等。
